? ? 香港赛马会期鸡肖
主頁 > 科技服務 > 轉錄組 > 真核轉錄組測序 >
真核轉錄組測序
 產品簡介

·             是基于HiSeq平臺,對真核生物特定組織或細胞在某個時期轉錄出來的所有mRNA進行測序,既可研究已知基因,亦能發掘新基因,全面快速地獲得mRNA序列和豐度信息。真核mRNA測序方法可以分為:有參考轉錄組、無參考轉錄組以及數字基因表達譜(DGE)三大類。
  
技術流程
 
·            
 
樣品要求
 
1)樣品類型:去蛋白并進行DNase處理后的完整總RNA;
2)樣品需求量:植物和真菌樣品≥10 μg;人、大鼠、小鼠樣品≥2 μg;其他類型動物≥5 μg;
3)樣品濃度:植物和真菌樣品≥250 ng/μl;人、大鼠、小鼠樣品≥65 ng/μl;其它類型動物樣品≥150 ng/μl;
4)樣品純度:OD260/280=1.8~2.2;OD260/230=1.8~2.2;動物樣品RIN≥7.0,植物樣品RIN≥6.5,28S:18S≥1.0;昆蟲樣本無此指標。
·              
 
案例解析

案例一 :轉錄組分析光敏色素PhyB如何調節高粱分蘗生長[1]

      光不僅是影響高等植物生長發育的一種重要的環境因子,而且可以作為一種重要的發育信號而調控植物形態建成。  其中的光敏色素phyB可以感受紅外和遠紅外光強比例控制植物分蘗生長。本研究中利用高粱phyB-1突變體直到開花后才進行分蘗生長特性,分別對突變型和野生型發芽后的6DAP、7DAP和8DAP進行轉錄組測。研究發現phyB-1植株中基因TFL1, TPPI, GA2ox1 表達量高,從而阻止了腋窩分生組織成花誘導,同時降低對糖信號的敏感性;而在野生型分蘗繼續生長,表現在關于SWEET  transporter 基因和細胞壁活性基因表達量升高,從而促使腋芽繼續生長;




參考文獻

[1]Kebrom TH, Mullet JE.Transcriptome Profiling of Tiller Buds Provides New Insights into PhyB Regulation of Tillering and Indeterminate Growth in Sorghum.Plant Physiol. 2016 Apr;170(4):2232-50. doi: 10.1104/pp.16.00014. 



 
?
科技服務 技術支持 聯系我們 市場活動 關于我們
香港赛马会彩图会员料